微生物的“身份证”:菌种编号的意义与解读

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微生物菌种编号就像是微生物的“身份证号”,它包含了许多关键信息。

简单来说,微生物菌种编号是一个唯一的、标准化的代码,用于在全球范围内准确识别和追踪一个特定的微生物菌株。

下面我们来详细分解这个编号的意义和各个部分:

一、核心意义与目的

1.唯一性标识:就像每个人都有唯一的身份证号一样,菌种编号确保了在科研、工业、医学等领域,当提到某个编号时,全世界的研究者指的都是在遗传和生理特性上完全相同的同一个菌株。这避免了因菌株名称混乱导致的错误。

2.可追溯性:通过编号,可以追溯到该菌株的完整“履历”:

来源:从何处分离(例如:土壤、人体、废水)。

分离者:是谁分离得到的。

分离时间:何时分离的。

特性:已知的生理生化特性、致病性、基因组信息等。

研究历史:有哪些研究使用过它,发表了什么成果。

3.标准化与交流:为全球科学家的交流提供了统一的标准。在论文中引用菌株编号是学术规范,确保了研究的可重复性和严谨性。

4.知识产权与资源保护:对于具有工业或商业价值的菌株,其在菌种保藏中心的编号是申请专利和保护生物资源的重要依据。

二、编号的常见组成部分

一个完整的菌种编号通常由两部分或三部分组成,我们以最常见的保藏中心编号为例:

【保藏机构缩写】 + 【顺序号】 +/- 【标识符】

1. 保藏机构缩写

这是编号的开头部分,指明这个菌株保存在哪个国际认可的菌种保藏中心。这是最重要的信息。

  • ATCC: American Type Culture Collection (美国典型培养物保藏中心)
  • CGMCC:China General Microbiological Culture Collection Center (中国普通微生物菌种保藏中心)
  • DSMZ:Leibniz-Institut DSMZ-Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen (德国微生物菌种保藏中心)
  • JCM:Japan Collection of Microorganisms (日本微生物菌种保藏中心)
  • KCTC:Korean Collection for Type Cultures (韩国典型培养物保藏中心)
  • NCTC:National Collection of Type Cultures (英国国家典型培养物保藏中心)
  • CICC:China Center of Industrial Culture Collection (中国工业微生物菌种保藏管理中心)

2. 顺序号

这是保藏中心内部赋予该菌株的一个唯一数字代码。例如,ATCC 25922 是第25922号入库的菌株。

3. 标识符(可选)

有时编号后面还会有额外的字母或数字,用于表示:

  • 变异株:如 -1, -mut 表示这是原始菌株的突变株。
  • 质粒信息:如带有特定质粒的工程菌。
  • 实验室内部编号:在未送入保藏中心前,研究者自己使用的临时编号。

三、举例说明

让我们解析几个著名的例子:

  • 大肠杆菌 Escherichia coli ATCC 25922
    • ATCC: 存放于美国典型培养物保藏中心。
    • 25922: 该中心给予的唯一序号。
    • 意义: 这是一个国际公认的药敏试验质控参考菌株。全球任何实验室在进行药敏试验时,如果使用ATCC 25922,其结果就具有可比性。
  • 枯草芽孢杆菌 Bacillus subtilis CGMCC 1.1850
    • CGMCC: 存放于中国普通微生物菌种保藏中心。
    • 1: 通常表示是细菌(不同保藏中心分类方式不同)。
    • 1850: 该类别下的唯一序号。
    • 意义: 这是一个常用于科研和酶制剂生产的标准菌株。
  • 金黄色葡萄球菌 Staphylococcus aureus NCTC 8325
    • NCTC: 存放于英国国家典型培养物保藏中心。
    • 8325: 唯一序号。
    • 意义: 这是一个被全基因组测序的、广泛应用于金黄色葡萄球菌分子生物学研究的经典菌株。

四、其他类型的编号(非保藏中心)

除了上述国际保藏中心的编号,您可能还会遇到:

1.实验室内部编号

 格式:通常是分离者姓名/实验室缩写 + 数字。例如:LAB-01, Zhang-2023-001。

 意义:在菌株被鉴定和送入保藏中心前,用于内部管理和识别。一旦送入保藏中心,就会获得一个正式的、永久的编号。

2.模式菌株的特定标识

在分类学中,代表一个物种的“标准”菌株称为模式菌株。在发表新物种时,必须指定一个模式菌株并将其送入保藏中心。在文献中,它通常写作:Streptomyces griseusISP 5236 (= NRRL B-2682 = JCM 4255 = ATCC 23345)

意义:这表示同一个模式菌株被多个保藏中心收藏,拥有不同的编号,但它们是同一个菌株。

总结

编号类型
示例
核心意义
保藏中心编号 ATCC 25922, CGMCC 1.1850 全球通用,永久唯一,可追溯。

是科学研究和工业应用的“黄金标准”。

实验室内部编号 LAB-01, Zhang-2023-001 临时性,内部管理使用。

便于在研究和鉴定过程中进行追踪。

模式菌株标识 B. subtilisDSM 10 分类学标准代表一个物种的“官方”参考菌株。

因此,当您看到一个微生物菌种编号时,它远不止是一个简单的代码。它背后连接着一个庞大而严谨的科学体系,确保了微生物资源的可靠性、可重复性和全球共享性。在您自己的研究或工作中,正确使用和引用菌种编号是至关重要的科学素养。

温馨提示:试剂为科研质控使用,不可用于临床及人体!非药用,非食用。